Nghiên cứu mới cho bệnh nhân ung thư đại trực tràng

Caris Life Sciences® sẽ trình bày những phát hiện giúp hiểu sâu hơn rằng biểu hiện khối u của gen liên quan đến mức độ tiếp xúc với thuốc, được phân tầng theo trạng thái p53, có liên quan đến kết quả lâm sàng trên các phác đồ hóa trị liệu phổ biến được sử dụng để điều trị ung thư đại trực tràng di căn (CRC). Những kết quả này sẽ được trình bày tại Hội nghị thường niên năm 2022 của Hiệp hội Nghiên cứu Ung thư Hoa Kỳ (AACR) được tổ chức từ ngày 8 đến 13 tháng 2022 năm XNUMX tại New Orleans, Louisiana.

Nghiên cứu với áp phích có tiêu đề, “Chữ ký gen gây ra bởi thuốc tiên lượng và dự đoán cho bệnh nhân ung thư đại trực tràng được cá nhân hóa dựa trên tình trạng p53 và điều trị bằng FOLFOX, 5-FU, oxaliplatin hoặc irinotecan” (Abstract # 1231), được dẫn đầu bởi Wafik El-Deiry , MD, Ph.D., FACP, Giám đốc Trung tâm Ung thư Legorreta của Đại học Brown, Phó trưởng khoa tại Trường Y Warren Alpert, thành viên của Caris 'Precision Oncology Alliance (POA). Caris 'POA là một mạng lưới ngày càng phát triển của các trung tâm ung thư hàng đầu trên toàn cầu hợp tác để thúc đẩy nghiên cứu ung thư chính xác và dựa trên dấu ấn sinh học. Công trình nghiên cứu này đang được trình bày tại New Orleans bởi Lindsey Carlsen, một nghiên cứu sinh về Bệnh học tại Phòng thí nghiệm EL-DEIRY tại Brown.

Mục tiêu của nghiên cứu này là xác định các dấu ấn sinh học dự đoán cho các liệu pháp hóa học được sử dụng trong CRC. Nghiên cứu sử dụng các dòng tế bào CRC để xác định các gen biểu hiện khác biệt sau khi điều trị bằng 5-fluorouracil, irinotecan hoặc oxaliplatin và phân tầng các dấu hiệu dựa trên trạng thái p53. Từ các nghiên cứu trong ống nghiệm này, các nhà nghiên cứu sau đó kiểm tra xem liệu các gen và dấu hiệu gen này có thể dự đoán kết quả của bệnh nhân CRC sau khi hóa trị (FOLFOX, 5-fluorouracil, irinotecan hoặc oxaliplatin) hay không. 2,983 mẫu bệnh nhân CRC p6,229 kiểu hoang dã và 53 mẫu bệnh nhân mất chức năng đã được phân tích bằng phương pháp giải trình tự DNA / RNA thế hệ tiếp theo tại Caris Life Sciences. Kết quả sống sót trong thế giới thực được suy ra từ dữ liệu yêu cầu bảo hiểm và ước tính của Kaplan-Meier. Cả biểu hiện gen tiên lượng và không tiên lượng đều có ảnh hưởng đáng kể đến kết quả sống sót sau khi điều trị bằng thuốc cụ thể.

El-Deiry cho biết: “Nghiên cứu này giúp chúng tôi hiểu được tầm quan trọng của chữ ký gen trong việc chứng minh khả năng tiên đoán nâng cao so với các bảng điểm riêng lẻ. “Kết nối giữa nghiên cứu cơ bản và lâm sàng, nghiên cứu này cho phép chúng tôi hiểu rõ hơn liệu pháp điều trị nào có nhiều khả năng mang lại lợi ích cho bệnh nhân CRC hơn.” Nghiên cứu cho thấy rằng biểu hiện khối u của các gen liên quan đến việc tiếp xúc với thuốc có thể dự đoán kết quả sau khi điều trị hóa trị:

• EGR1 cao và mRNA FOS dự đoán độc lập đáp ứng với FOLFOX ở những bệnh nhân có khối u p53 kiểu hoang dã.

• mRNA CCNB1 thấp tương quan với tiên lượng tốt của bệnh nhân CRC có khối u chứa TP53 đột biến mất chức năng.

• Biểu hiện thấp của BTG2 dự đoán tiên lượng tốt hơn ở những bệnh nhân có khối u đột biến TP53 cao MSI.

• Chữ ký gen có thể chứng minh khả năng tiên đoán được nâng cao so với các hiệu ứng sao chép riêng lẻ.

W. Michael Korn, MD, Giám đốc Y tế tại Caris cho biết: “Caris tập trung vào các dấu ấn sinh học có thể dự đoán phản ứng của bệnh nhân với các liệu pháp mới nhất, cũng như các liệu pháp hóa học đã được thử nghiệm và thực sự như FOLFOX. “Chúng tôi rất vui khi thấy khả năng nghiên cứu phiên dịch được hỗ trợ bởi các công cụ phân tích và dữ liệu đa phương thức to lớn mà Caris đã phát triển và tiếp tục đạt được tiến bộ.”

Hồ sơ phân tử toàn diện của Caris đánh giá toàn bộ exome (DNA), toàn bộ phiên mã (RNA) và biểu hiện protein, cung cấp một nguồn lực chưa từng có và con đường lý tưởng để tiến hành nghiên cứu dịch mã nhằm tăng tốc khám phá để phát hiện, chẩn đoán, theo dõi, lựa chọn liệu pháp và phát triển thuốc để cải thiện tình trạng con người.

Caris sẽ trình bày dữ liệu bổ sung từ các nghiên cứu chứng minh vai trò quan trọng của y học chính xác và cấu hình phân tử trong điều trị ung thư. Tất cả các bài thuyết trình sẽ được cung cấp trực tuyến thông qua trang web của Caris bắt đầu từ ngày 8 tháng 2022 năm XNUMX.

Trình bày bổ sung Tiết lộ tác động của việc lập hồ sơ phân tử toàn diện và khả năng hoạt hóa lâm sàng tiềm năng

• Đặc điểm toàn diện của sự thay đổi FGF / FGFR trong ung thư vú xâm lấn (Tóm tắt # 5793) Tín hiệu FGFR là trung tâm cho sự tăng sinh, di cư, hình thành mạch và sống sót của tế bào ung thư; Các thay đổi FGFR đã trở nên có thể thực hiện được trên lâm sàng với số lượng ngày càng tăng các loại ung thư. Nghiên cứu này đã đánh giá tỷ lệ mắc và đặc điểm của nhiều biến đổi FGF / FGFR trong hơn 12,000 ca ung thư vú xâm lấn và làm nổi bật sự không đồng nhất to lớn của những thay đổi FGF / FGFR trong các phân nhóm mô học và phân tử khác nhau cũng như các vị trí di căn khác nhau của ung thư vú. Hơn nữa, mối liên quan giữa sự thay đổi FGFR và khả năng kháng lại các liệu pháp đã được hiển thị trong một cơ sở dữ liệu lâm sàng lớn với các kết quả phân tử phù hợp.

• Đặc điểm gen và miễn dịch của các phân nhóm EGFR trong ung thư phổi không phải tế bào nhỏ (NSCLC) (Abstract # 4119) Trong khi các khối u NSCLC đột biến EGFR thường đề kháng với các chất ức chế PD-1 / PD-L1, một nhóm nhỏ bệnh nhân có thể có các phản ứng bền vững . Các khối u đột biến EGFR chứng tỏ sự không đồng nhất về mặt phân tử đáng kể, tuy nhiên, thiếu sự rõ ràng về cấu hình gen và miễn dịch của các loại phụ đột biến EGFR, và việc làm sáng tỏ thêm điều này có thể giúp xác định những bệnh nhân có khả năng đáp ứng với các liệu pháp miễn dịch. Dựa trên dữ liệu phân tử đa gen được tạo ra bởi Giải trình tự DNA và RNA thế hệ tiếp theo trên một nhóm lớn các khối u NSCLC, nghiên cứu này xác nhận việc giảm khả năng sinh miễn dịch liên quan đến hầu hết các loại phụ của đột biến EGFR được biểu hiện bằng các dấu ấn sinh học bao gồm PD-L1, TMB và CD8 + T xâm nhập tế bào; và cho thấy các đột biến EGFR hiếm có liên quan đến cấu hình miễn dịch thuận lợi có thể gợi ý khả năng đáp ứng với liệu pháp miễn dịch.